青河在秦汉时期是匈奴游牧地。隋代居西突厥。唐代归北庭都护府管辖。清乾隆二十八年（1763年）为科市多参赞大臣管辖。清光绪三十年（1904年），改属阿尔泰办事大臣管辖。民国26年（1937年）设置青格里河没治局。民国 30年（1941年）升格为县，称青河县，先后隶属第六行政区和阿山专区。中华人民共和国成立后相继隶属阿勒泰专区和阿勒泰地区。
青河县自然环境复杂是珍禽异兽繁衍生存的生态保护区，拥有河狸、鹅喉羚、北山羊、盘羊、紫貂、红隼、雪豹、棕熊、天鹅等几十种珍禽异兽在此地繁衍生息。特别是河狸作为国家一类保护动物，在世界仅分布两处，青河布尔根河狸保护区是其中一处，布尔根河流域密林丛生，水流平缓，素有“生物活化石”之称河狸在树从中觅食、嬉戏、憨态可掬，是人们观赏研究野生动物的重要窗口。
青河县境内高山、兵陵、盆地纵横交错，大小青河、查干河、布尔根河及交汇河流乌伦古河横贯县境，形成了高山湖泊、河谷丛林、奇山峻岭独具特色的景区。套查干郭勒湖景区，海拔2396米，每年有10个月为冰封期，湖泊周围山石峥嵘，奇峰凌空，一年四季，白雪皑皑，银光四射，湖水清澈如镜，天上的日月星辰，周围奇峰峻岭、湖边花草树木映入湖中，美不胜收。河谷沿岸的万亩白桦林，棵棵清秀挺拔、绿草如茵、野花遍地、点点毡房点缀其中，是休闲避暑、体验民族风情的绝好去处。东部哈林高山林区，风景自上而下各不相同，针阔林混交构成多树种、多层次的优美森林环境，雨季瀑布迭起，景观神奇状丽。奇特的地理景观。有1931年8级大地震形成长达176公里的二台地震断裂带，最深达78米，终年不见阳光，强罕沟世界三大铁陨石群更是令人叹为观止，陨石分布奇特，三五一堆，七八成群；近年又发现了黄泥滩处2.5公里的硅化木群，场面状观，实为罕见。
