莫旗历史悠久，远在石器时代，就有人类祖先在这里生息活动；商、周、春秋时期为古貊活动区；秦汉、三国时期为夫余人属地；南北朝时期为乌洛人居住地；五代后，契丹人统一北方建辽；公元1125年女真族建金朝并逐步统一东北地区，在今尼尔基镇后宜卧奇村东嫩江边筑达里带石堡子。元代属成吉思汗三弟帖木哥斡赤斤封地；明初为福余卫属地；清代，为宁古塔昂帮章京管理地。这里的主体民族达斡尔族是在清初时从黑龙江以北迁到此地生活。
达斡尔族人原分布于外兴安岭以南精奇里江(今俄罗斯境内吉雅 河)河谷与东起牛满江(今俄罗斯境内布列亚河)，西至石勒喀河的黑龙江北岸河谷地带。17世纪中叶由于沙俄殖民者入侵黑龙江流域，江北达斡尔、鄂伦春、鄂温克等族人民受到野蛮的掠夺与屠杀，被迫内迁。达斡尔族自清崇德年间迁居嫩江流域。康熙二十八年（1683年）在莫旗后宜卧奇村设布特哈总管衙门。自此，这里成为布特哈地区政治、经济、文化中心。
在民国初年莫旗地区属黑龙江省管辖。1945年8月日本投降后建立布西县，成立"布西地方解放委员会 "，代理地方政务。1946年1月11日，在中国共产党领导下成立了布西县政府，隶属于嫩江省二行署。1954年莫旗归呼伦贝尔盟管辖。1958年8月 15日，经国务院批准成立莫力达瓦达斡尔族自治旗，实现了民族区域自治。至此，莫力达瓦人民在党的民族政策光辉照耀下，正在建设小康社会的大道上阔步前进。
